Con i cambiamenti avvenuti in seno alla società nel corso del XX secolo, sono mutate anche le malattie e le cause di decesso. Se fino al XIX secolo le malattie infettive erano la causa più frequente di decesso, queste hanno ora ceduto il posto alle malattie cardio-vascolari, al cancro e alle malattie respiratorie, le cosiddette malattie non trasmissibili.
La FMH segue attivamente gli sforzi in materia di promozione della salute e di prevenzione nel settore delle malattie non trasmissibili.