Die FMH hat eine eigene eHealth-Strategie erarbeitet, welche auf den strategischen Zielen der FMH für die Legislaturperiode 2008–2012 basiert. Die eHealth-Strategie macht Aussagen zu den Themen:
Auch der Bund hat zusammen mit den Kantonen eine nationale Strategie «eHealth» erarbeitet. Diese soll im Rahmen des Koordinationsorgans eHealth Bund-Kantone umgesetzt werden. Die FMH ist in den verschiedenen Gremien und Projektgruppen vertreten und engagiert sich für eine Ausgestaltung im Sinne der Ärzteschaft.