Die FMH setzt sich dafür ein, dass das Tarifsystem SwissDRG in der stationären Akutsomatik möglichst leistungsgerecht ausgestaltet wird. Sie nutzt ihre Möglichkeit, die Anliegen der Ärzteschaft im Verwaltungsrat und in den verschiedenen Gremien der SwissDRG AG aktiv einzubringen. Dabei stützt sie sich unter anderem auf die FMH-Fachkommission SwissDRG, in welcher die Anliegen der Dachverbände und der medizinischen Fachgesellschaften gebündelt werden.
Die FMH trägt zudem zur laufenden Weiterentwicklung der Tarifstruktur bei, indem sie sich in den entsprechenden Gremien des Bundesamts für Statistik engagiert und Vertreter der Fachgesellschaften beim jährlichen Antragsverfahren zur Pflege der Prozedurenklassifikation CHOP unterstützt.